最盛期には各国に支部が置かれ、会員は貴族、大富豪、政治家、インテリなど2000人(一説では6000人)に及んだという。
組織には並行してフリーメイソンに入会していた者も多かった。
「シンボル」による人間の意識への働きかけを考察した神秘主義者カール・エッカルツハウゼンも団員だったとされる。

アダムはフリーメイソンのベルリン・ロッジ(支部)に忠実な部下を潜入させ、ロッジの認可証を手にれ、ミュンヘンのロッジを乗っ取る。
これにはメイソンの運営のやり方を取り込む思惑もあったとされる。
その後メイソン有力者の入団もあり、組織の位階制を13位階以上から構成されるメイソン風に変えた。

↓アダム・ヴァイスハウプト



さらにメーソンの人脈を利用し、ドイツ各地の小ロッジを次々に乗っ取ったり、貴族、政治家、高級官僚、学者、医者、高位聖職者、軍人等の有力者たちが次々に参入した。
組織の肥大化と共に、イルミナティは政治色を強めていき、それは急進的な反王制、反教会的な革命を含んだ政治思想であった。
言うまでも無く、反イエズス会の態度は、教会をも敵にまわす事になる。

1777年にマクシミリアン3世が死去すると、イエズス会が勢いを盛り返す。
更に廃止されていた本の検閲と禁書制度が復活した。
さらにフリーメイソンの反撃によってフランクフルト進出に失敗。
そしてベルリンにおいては、かの「薔薇十字団」が最盛期を迎えており、彼らはドイツ皇帝を動かしてイルミナティに圧力を加えた。
最悪なことに、この大事な時期にイルミナティ内部で深刻な内部抗争が勃発した。
このような争いの連鎖が、事実上のイルミナティの崩壊に繋がったとされる。
ここまでが実際に存在したイルミナティの歴史である。

歴史上、アダム・ヴァイスハウプトがイルミナティを設立した事になっているが、イルミナティ信仰はそのはるか昔からも存在したと言われている。
ユダヤ教徒の聖典であり、イルミナティの理念にもなっている「シオンの議定書」を執筆依頼したのが、
旧約の時代に神の戒律を破った呪われたカナンの子であるユダヤ人種であり、また、歴代のトップもユダヤ人が務めたなどと噂される。
イルミナティの結社としての活動は1785年に終わったとされるが、今現在もその思想を受け継いで活動している団体があるという説がある。