Post de Académie des sciences

Proposition d'une bourse de thèse financée (2024-2027) dont le sujet est : « Large invasion des génomes d’insectes par un élément transposable : génomique des populations impactées » à l’Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte, UMR 7261 CNRS / Université de Tours (https://lnkd.in/dMXvY6h)   Le projet de recherche de la thèse a pour but de mesurer la proportion d’espèces touchées dans la biodiversité et d’essayer d’identifier un des fronts d’invasion. Il s’agira également d’estimer la date où l’invasion a débuté en Europe en utilisant des collections de musées. Enfin la comparaison de l’organisation des insertions de l’ET dans les génomes d’individus différents d’une espèce de Lépidoptère par génomique des populations fournira des informations sur l’impact initial -pathogène ou non- du transposon.  Objectifs : caractériser l'étendue de l'épidémie dans la zone de distribution géographique de deux espèces et déterminer la proportion d'espèces touchées en Europe et dans d'autres régions du monde. Fournir une estimation de l'age de l'invasion en Europe. Identifier des régions où le processus est encore en cours.  La thèse sera encadrée par Jean-Michel DREZEN (drezen@univ-tours.fr) et Elisabeth HUGUET (elisabeth.huguet@univ-tours.fr)   Les candidat(e)s sont invité(e)s à déposer leur candidature sur ADUM à l’École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant - SSBCV - Spécialité Biologie ici : https://lnkd.in/eGR5gJTH avant le 26 mai 2024.   Nous recherchons un(e) candidat(e) ayant de bonnes notions en génétique/génomique des populations, un intérêt pour les thématiques d’évolution, une compétence ou au moins une appétence pour la bio-informatique. Une fibre naturaliste et pour la collecte de terrain serait des plus. L’étudiant(e) devra interagir avec de nombreux partenaires dans le cadre du projet ANR Invatranspo et du réseau Lepidoptériste européen.   Le/la candidat(e) retenu(e) rejoindra à partir du 1er octobre 2024 un environnement scientifique international, interactif et dynamique à l’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (UMR7261, CNRS, Université de Tours), avec accès à des laboratoires très bien équipés.

L’évolution est moins aléatoire qu’on le pensait, révèle une étude Elle suggère que l’histoire génétique d’un organisme pourrait jouer un rôle déterminant dans son évolution, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives dans notre compréhension de la biologie évolutive. En outre, elle ouvre des voies prometteuses pour des applications concrètes, notamment dans le développement de traitements médicaux ciblés et de stratégies de conservation de la biodiversité, tout en offrant un nouvel éclairage sur la réponse des espèces aux changements environnementaux. La nouvelle étude suggère que le parcours évolutif d’un génome n’est pas simplement le fruit du hasard ou de la sélection naturelle, mais qu’il peut être fortement influencé par son propre historique génétique. Les mutations et les adaptations ne seraient ainsi plus des événements imprévisibles. En identifiant des schémas et des tendances au sein de l’évolution génomique, les chercheurs ont pu démontrer que certains aspects de l’évolution pourraient être anticipés, en fonction des caractéristiques génétiques héritées d’un organisme. « Les implications de cette recherche sont tout simplement révolutionnaires. En démontrant que l’évolution n’est pas aussi aléatoire qu’on le pensait, nous avons ouvert la porte à un éventail de possibilités en biologie synthétique, en médecine et en sciences de l’environnement ». https://lnkd.in/dagh8M63

[Recherche] 4 chercheurs d'Université Côte d’Azur dans le "Palmarès des inventeurs 2024"👏 Lucie Monticelli Patrick Collombat Thierry Passeron et Rachid BENHIDA font partie du palmarès publié par le journal Le Point "Les 100 inventeurs 2024" publié le 29 février 2024. Il met en lumière des femmes et des hommes qui s'appuient sur la science et la recherche fondamentale pour changer le monde. ➡️En savoir plus : https://bit.ly/3VmwjwB Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU de Nice) Institut Chimie Nice institut de Biologie Valrose - iBV Inserm INRAE CNRS - Centre national de la recherche scientifique CNRS Délégation Côte d'Azur C3M - Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire #recherche #UniCA #daretocreate #chercheurs #research Université Côte d'Azur - Recherche et Valorisation

Les vorticelles, des organismes unicellulaires fascinants, sont souvent négligées dans les discussions sur la biodiversité et la biotechnologie. Cependant, leur structure complexe et leur mode de vie unique offrent un aperçu précieux des mécanismes biologiques fondamentaux et des applications potentielles dans divers domaines, de l'écologie à la médecine. Cet article explore la beauté cachée et l'importance scientifique des vorticelles, mettant en lumière pourquoi ces micro-organismes méritent notre attention. Qu'est-ce qu'une vorticelle? Les vorticelles sont des protozoaires qui appartiennent à la classe des ciliés. Elles sont reconnaissables à leur forme caractéristique de cloche ou de vase, soutenue par un long pédoncule qui les fixe à des substrats dans des environnements aquatiques. Ce qui distingue les vorticelles, c'est leur capacité à se contracter rapidement en réponse à des stimuli, une caractéristique qui les aide à échapper aux prédateurs et à capturer des proies. L'importance écologique des vorticelles Les vorticelles jouent un rôle crucial dans les écosystèmes aquatiques. En tant que consommateurs de bactéries et d'autres petites particules organiques, elles contribuent à la régulation des populations microbiennes et à la purification de l'eau. Leur présence est souvent un indicateur de la santé écologique d'un milieu aquatique. #edutok #science #biology #scienceeducation #microorganisms #microscopy #vorticelle #Microbiologie #biotechnologies #ScienceDeLEau #biodiversitéaquatique #innovation #ÉcosystèmesAquatiques #recherchebiologique #BiologieCellulaire #microscope #BiologieDesProtozoaires

Proposition de thèse dont le sujet a été retenu pour le concours de l'école doctorale ABIES à Paris au sein du laboratoire Ecosens de l'institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris. Ce sujet porte sur l'écologie sensorielle et l'implication d'une famille enzymatique sur les capacités olfactives des insectes. Les Glutathion S-Transférases (GSTs) sont des enzymes clés du métabolisme des xénobiotiques, majoritairement étudiées chez les insectes pour leur rôle dans la biotransformation des allélochimiques de plantes et la résistance aux insecticides. Cependant nombre de GSTs sont étonnamment associées au système chimiosensoriel (olfactif et gustatif) où leur(s) fonction(s) reste peu connue, alors même que la communication chimique est à la base de nombreux traits d’histoire de vie des insectes (choix de la source de nourriture, du partenaire …) et participe à leurs remarquables capacités adaptatives. La diversité et la fonction des GSTs dans les organes chimiosensoriels restent à établir, afin d’analyser leur implication possible dans la protection des neurones sensoriels contre les xénobiotiques, ou la modulation de la quantité et qualité du signal chimique détecté. Notre objectif est d’étudier la diversité et la fonction de GSTs chez la drosophile D. melanogaster, modèle pour étudier la communication chimique des insectes, et d’aborder - via une comparaison avec une espèce ravageuse d’écologie chimique très différente, D. suzukii - la contribution possible de ces GSTs chimiosensorielles à l’écologie chimique de ces espèces. La personne recrutée sera intégrée dans l’équipe CREA où sont développées des approches intégratives "du gène au comportement" combinant des expériences in vivo et in vitro. En particulier, la thèse visera à 1) identifier le répertoire complet des GST chez D. melanogaster, 2) comparer finement les patrons d’expression de ces gènes par des approches de RT-qPCR et d’imagerie, 3) caractériser in vitro l’activité des gènes identifiés afin de déterminer leurs fonctions exactes dans l’olfaction, 4) caractérisant in vivo quelques gènes candidats les plus prometteurs par des analyses comportementales et électrophysiologiques et 5) de comparer les GSTomes chimiosensoriels de D. melanogaster et de D. suzukii par des approches in silico. Les étudiants intéressés doivent être titulaires d'un master 2 avec des compétences dans des domaines en physiologie, neuroscience des insectes, ou en écologie chimique... La direction de thèse sera assurée par Martine et Maïbèche (directrice) et Thomas Chertemps (co-encadrant). martine.maibeche@sorbonne-universite.fr, thomas.chertemps@sorbonne-universite.fr Si vous souhaitez candidater, veuillez envoyer un CV détaillé, une lettre de motivation et les contacts de deux ou trois références. Les candidatures seront examinées au fur et à mesure, mais ne devront pas être reçues après le 30 avril

🧬La pierre philosophale de la biologie 🧬 Bioptimus, le spin-off d'Owkin développant un modèle de fondation sur la biologie, vient d’annoncer un seed round de $35m mené par Sofinnova Partners - auquel nous avons évidemment participé avec Frst. Étant investisseurs d’Owkin depuis quasiment le premier jour, et ayant eu la chance de côtoyer Jean-Philippe depuis plusieurs années, il faut reconnaître que cela n’a pas été la décision d’investissement la plus difficile à prendre. L’équipe Bioptimus dirigée par Jean-Philippe et Rodolphe regroupe quelques-uns des rares experts mondiaux du sujet, et va s’appuyer sur l’expertise, la crédibilité et les partenariats déjà établis par Owkin. La biologie est depuis longtemps identifiée comme l’un des champs d’application de l’IA les plus prometteurs, avec des premiers succès tels qu’Alphafold (Deepmind) ou ESMfold (Meta). Pourtant jusqu’ici ces différentes initiatives traitaient un seul “niveau” de la biologie (séquençage du génome, construction de protéines…) - limitant de ce fait leur potentiel d’application tant sont complexes les interactions entre les différents “niveaux” de la biologie (génétique, épigénétique, protéomique, cellulaire, tissulaire…). L’émergence récente des “modèles de fondation” (GPT, Llama, Mistral…), combinée à l’apparition progressive de datasets “multi-modaux” (grâce notamment à Owkin !) permet d’espérer dépasser cette frontière et développer une compréhension réelle de la façon dont les différentes couches de la biologie interagissent pour aboutir à telle ou telle caractéristique d’un organisme vivant. Les mécanismes biologiques étant les mêmes à travers l’ensemble du vivant, un tel modèle permettrait d’accélérer massivement les découvertes tant en biotechnologie, qu’en chimie et en agronomie - avec à la clé des bénéfices insondables pour le progrès humain. Go team Bioptimus!

URGENT ! Date limite 30 Avril ! A partager ! Nous sommes à la recherche d'un(e) candidat(e) pour porter un sujet de #thèse qui a été retenu pour le concours de l'école doctorale ABIES à Paris au sein du laboratoire Ecosens de iEES Paris. Ce sujet de thèse porte sur l' #écologie sensorielle et l'implication d'une famille enzymatique sur les capacités olfactives des #insectes. Les Glutathion S-Transférases (GSTs) sont des enzymes clés du métabolisme des #xénobiotiques, majoritairement étudiées chez les insectes pour leur rôle dans la biotransformation des #allélochimiques de #plantes et la résistance aux #insecticides. Cependant nombre de GSTs sont étonnamment associées au système chimiosensoriel (olfactif et gustatif) où leur(s) fonction(s) reste peu connue, alors même que la communication chimique est à la base de nombreux traits d’histoire de vie des insectes (choix de la source de nourriture, du partenaire …) et participe à leurs remarquables capacités adaptatives. La diversité et la fonction des GSTs dans les organes chimiosensoriels restent à établir, afin d’analyser leur implication possible dans la protection des #neurones sensoriels contre les xénobiotiques, ou la modulation de la quantité et qualité du signal chimique détecté. Notre objectif est d’étudier la diversité et la fonction de GSTs chez la drosophile D. melanogaster, modèle pour étudier la communication chimique des insectes, et d’aborder - via une comparaison avec une espèce ravageuse d’écologie chimique très différente, D. suzukii - la contribution possible de ces GSTs chimiosensorielles à l’écologie chimique de ces espèces. La personne recrutée sera intégrée dans l’équipe CREA où nous développons de longue date des approches intégratives "du #gène au #comportement " combinant des expériences in vivo et in vitro. En particulier, la thèse visera à 1) identifier le répertoire complet des GST chez D. melanogaster, 2) comparer finement les patrons d’expression de ces gènes par des approches de RT-qPCR et d’imagerie, 3) caractériser in vitro l’activité des gènes identifiés afin de déterminer leurs fonctions exactes dans l’ #olfaction , 4) caractérisant in vivo quelques gènes candidats les plus prometteurs par des analyses comportementales et électrophysiologiques et 5) de comparer les GSTomes chimiosensoriels de D. melanogaster et de D. suzukii par des approches in silico. Profil et compétences requises Les étudiants intéressés doivent être titulaires d'un master 2 avec des compétences dans des domaines de ce projet de thèse (en physiologie, neuroscience des insectes, ou en écologie chimique....). Cette thèse étant pluridisciplinaire, une appétence et des capacités d'adaptations aux différentes approches est nécessaire. La direction de thèse sera assurée par Martine et Maïbèche (directrice) et Thomas Chertemps (co-encadrant). Envoyez votre candidature avant demain, 30 avril ! Contact : martine.maibeche@sorbonne-universite.fr, thomas.chertemps@sorbonne-universite.fr

3 règles pour médiatiser, avec vigilance, la science.

📢 C'est le jour J ! 🗓️ Le moment tant attendu où l'on vous fait découvrir le 1er épisode de notre podcast « 40 ans de Biologie au service de l'Histoire ». Sujet du jour : Les grandes découvertes de la biologie depuis 40 ans 🔬🧪 ➡️ https://qr.link/Enq9sx Voyage à travers quatre décennies de découvertes scientifiques et technologiques en biologie 🚀👇 ----------- AU SOMMAIRE ----------- CHAPITRE 1 : les spectaculaires avancées génétiques 👉 Nous découvrons comment des avancées révolutionnaires telles que le #séquençage et #CRISPRCas9 ont transformé la génétique et la thérapie génique, et explorons les applications concrètes de ces technologies dans la santé humaine et l'agriculture. Valérie Prouzet-Mauléon nous parle de génétique animale et Marie-christine Birling partage son expertise sur le potentiel des outils d'édition génomique pour traiter des maladies monogéniques. De leur côté, Pascal BARBRY et francis Rousseau reviennent sur le contexte historique du séquençage du génome humaine et sur ses implications dans la médecine et la recherche actuelle. CHAPITRE 2 : la découverte et l’exploration du microbiome 👉 Nous plongeons dans l'univers du #microbiome avec Hervé Blottière et francis Rousseau, fantastique exploration de nos intestins directement induite du séquençage de nouvelle génération (#NGS) CHAPITRE 3 : l’exploration du potentiel des cellules souches 👉 Jean-Emmanuel Sarry nous éclaire sur les défis et les promesses de l'utilisation des #CellulesSouches en médecine régénérative et en cancérologie. CHAPITRE 4 : L’apport et les défis de la bio-informatique et de l’analyse des données 👉 Nos invités du jours décryptent pour nous les enjeux des données – leur production mais surtout leur exploitation – dans la biologie d'aujourd'hui et de demain. _____ Que vous soyez un passionné de biologie ou un curieux en quête de connaissances, branchez votre casque, écoutez les récits de nos invités et laissez-vous emporter par ces aventures exceptionnelles que nous avons choisi de vous raconter à l'occasion des #40ans d'Ozyme. Écoutez ce 1er épisode sur votre plateforme d'écoute préférée ou sur Ozyme.fr ➡️ https://qr.link/Enq9sx ----------- #biologie #recherche #science #podcast #séquençagegénomique #cellulessouches #microbiome #CRISPR #bioinformatique

[📰 𝗔 𝗹𝗶𝗿𝗲 𝗱𝗮𝗻𝘀 𝗹𝗲 Ouest-France] Déjà implanté à Saint-Malo, Dinard (Ille-et-Vilaine) et Dinan (Côtes-d’Armor), le groupe Ouest Biologie a ouvert un nouveau laboratoire à Pleurtuit. Article rédigé par Charles Drouilly dont voici quelques extraits : « 𝘊’𝘦𝘴𝘵 𝘶𝘯𝘦 𝘣𝘰𝘯𝘯𝘦 𝘯𝘰𝘶𝘷𝘦𝘭𝘭𝘦 𝘱𝘰𝘶𝘳 𝘭𝘦𝘴 𝘩𝘢𝘣𝘪𝘵𝘢𝘯𝘵𝘴 𝘥𝘦 𝘗𝘭𝘦𝘶𝘳𝘵𝘶𝘪𝘵 (𝘐𝘭𝘭𝘦-𝘦𝘵-𝘝𝘪𝘭𝘢𝘪𝘯𝘦). 𝘋𝘦𝘱𝘶𝘪𝘴 𝘭𝘦 15 𝘢𝘷𝘳𝘪𝘭 2024, 𝘱𝘭𝘶𝘴 𝘣𝘦𝘴𝘰𝘪𝘯 𝘥’𝘢𝘭𝘭𝘦𝘳 𝘫𝘶𝘴𝘲𝘶’à 𝘋𝘪𝘯𝘢𝘳𝘥 𝘰𝘶 𝘋𝘪𝘯𝘢𝘯 𝘱𝘰𝘶𝘳 𝘧𝘢𝘪𝘳𝘦 𝘥𝘦𝘴 𝘢𝘯𝘢𝘭𝘺𝘴𝘦𝘴 𝘥𝘦 𝘣𝘪𝘰𝘭𝘰𝘨𝘪𝘦 𝘮𝘦́𝘥𝘪𝘤𝘢𝘭𝘦. » [...] « 𝘊𝘦𝘭𝘢 𝘮𝘢𝘯𝘲𝘶𝘢𝘪𝘵, 𝘤𝘰𝘯𝘧𝘪𝘦𝘯𝘵 𝘥’𝘦𝘮𝘣𝘭é𝘦 Sally D. 𝘦𝘵 𝘔𝘢𝘵𝘵𝘩𝘪𝘦𝘶 𝘙𝘰𝘣𝘦𝘳𝘵, 𝘣𝘪𝘰𝘭𝘰𝘨𝘪𝘴𝘵𝘦s. 𝘓𝘢 𝘥é𝘮𝘰𝘨𝘳𝘢𝘱𝘩𝘪𝘦 𝘦𝘴𝘵 𝘦𝘯 𝘩𝘢𝘶𝘴𝘴𝘦 𝘦𝘵 𝘗𝘭𝘦𝘶𝘳𝘵𝘶𝘪𝘵 𝘦𝘴𝘵 𝘭𝘢 𝘥𝘦𝘶𝘹𝘪è𝘮𝘦 𝘷𝘪𝘭𝘭𝘦 𝘥𝘦 𝘭𝘢 𝘤𝘰𝘮𝘮𝘶𝘯𝘢𝘶𝘵é 𝘥𝘦 𝘤𝘰𝘮𝘮𝘶𝘯𝘦𝘴. 𝘐𝘭 𝘺 𝘢 𝘥𝘰𝘯𝘤 𝘥𝘦𝘴 𝘣𝘦𝘴𝘰𝘪𝘯𝘴 𝘧𝘰𝘳𝘵𝘴 𝘦𝘯 𝘮𝘢𝘵𝘪è𝘳𝘦 𝘥𝘦 𝘴𝘢𝘯𝘵é. » ▶️ Consultez l'article dans son intégralité : https://lnkd.in/es2GNqM5 #ouestbiologie #pleurtuit #laboratoire #sante #biologie #ouverture