Je suis ravi de ma participation à JOBIM 2024 (Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques), où j'ai eu l'occasion de présenter un poster sur une comparaison de méthode pour la caractérisation du microbiote circulant à partir de données de transcriptomiques de sang humain. Cette conférence a été une excellente opportunité pour partager mon travail et échanger avec d’autres chercheurs de la bioinformatique. #Jobim2024 #Bioinformatique
Post de Antonin Colajanni
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Je suis ravi de partager avec vous mon nouveau certificat en Bioinformatique, obtenu après avoir suivi le cours "BIOINFORMATICS COURSE 201" dispensé par l'Institut Genomac. Ce cours m'a permis de développer mes compétences en bioinformatique, notamment en ce qui concerne les fondements de la bioinformatique, les technologies de séquençage de l'ADN, l'identification des codons et des protéines, la génomique comparative, l'exploration des familles de gènes et l'annotation fonctionnelle à travers les espèces. Je suis convaincu que ces compétences me seront très utiles dans ma carrière future en biotechnologie et en recherche scientifique. Je tiens à remercier l'Institut Genomac pour cette opportunité de formation et je suis impatient de continuer à apprendre et à me développer dans ce domaine. #Bioinformatique #Biotechnologie #RechercheScientifique #Formation #Certificat
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🎓 Je suis ravi(e) de partager que j'ai récemment obtenu un Diplôme en Bioinformatique grâce à #Alison ! 🌟 Ce cours m'a permis d'acquérir des compétences approfondies et pratiques dans plusieurs domaines clés de la bioinformatique, notamment : 🗨 Définition de la génomique et de la protéomique : Compréhension de leur rôle crucial en bioinformatique. 🐱 Analyse des séquences : Description des différentes étapes impliquées dans le processus d'analyse des séquences biologiques. Analyse des réseaux biologiques : Explication des approches utilisées pour étudier les réseaux biologiques complexes. 💊 Conception et découverte de médicaments : Résumé du rôle de la bioinformatique dans le développement de nouveaux médicaments et traitements. 🧬Analyse des #SNPs et données NGS : Définition des SNPs et fondamentaux de l'analyse et de l'interprétation des données de séquençage de nouvelle génération (NGS). 💻 #Algorithmes et modèles computationnels : Présentation de divers algorithmes et modèles utilisés en #bioinformatique. 👨⚕️ #Médecine personnalisée et de précision : Explication de ces concepts et de leur application en bioinformatique. Je suis enthousiaste à l'idée de mettre en pratique ces nouvelles compétences et d'explorer les opportunités professionnelles dans ce domaine fascinant. Un grand merci à Alison ! Si vous souhaitez en savoir plus sur la bioinformatique ou discuter des opportunités dans ce domaine, n'hésitez pas à me contacter 🤗 . #Bioinformatique #Diplôme #Génomique #Protéomique #AnalyseDesSéquences #DécouverteDeMédicaments #MédecinePersonnalisée #Alison #FormationContinue
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#Formation Les inscriptions pour la 2ème édition de l'école de bioinformatique Aviesan- IFB-INSERM dédiée à l’assemblage et l’annotation de novo de génomes et métagénomes sont ouvertes jusqu'au 15 février. La formation, qui se déroulera du 2 au 7 juin 2024 à Roscoff, s’adresse à des personnes directement impliqués dans des projets de séquençage et d'annotation de génomes procaryotes, eucaryotes, et métagénomiques (hors analyse amplicon), à partir de données NGS “long reads” et “hybride”. La formation ne suppose pas de prérequis. L’école vise à : - introduire les concepts fondamentaux liés aux différentes étapes de traitement de données de génomique (contrôle qualité des données, assemblage, scaffolding, polishing, annotation structurale et fonctionnelle les procaryotes et les eucaryotes) et de métagénomique (assemblage, binning, assignation taxonomique, etc.) ; - manipuler les outils informatiques et à en interpréter les résultats. Concernant la métagénomique, les méthodes par amplicon ne seront pas étudiées. La formation est basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et initier le traitement de leurs propres données ou de celles de leur équipe. Toutes les informations sur cette formation sont sur : https://lnkd.in/etHHz9eS
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Diplômé d’un master en Biologie des Plantes & Microorganismes Associés 🌱 | À la recherche d'opportunités pour cultiver l'avenir du vivant 🔎
[🎯 À la recherche d'une opportunité en biologie ! 🎯] Cher réseau LinkedIn 🌐 Je n’ai pas pour habitude de prendre la parole en public, néanmoins j’espère capter votre attention au mieux ! Récemment, j’ai été diplômé d’un Master mention "Biologie des Plantes & Microorganismes Associés (BPM@)" à l’Université Toulouse III Paul Sabatier. Durant ces deux années très enrichissantes, je me suis familiarisé avec une myriade de notions fondamentales de la biologie végétale, incluant l’immunité, le développement, la physiologie, et bien d'autres. 💡 𝗘𝘅𝗽𝗲́𝗿𝗶𝗲𝗻𝗰𝗲𝘀 𝗺𝗮𝗿𝗾𝘂𝗮𝗻𝘁𝗲𝘀 : -𝗦𝘁𝗮𝗴𝗲 𝗮𝘂 𝗟𝗥𝗦𝗩 - 𝗖𝗡𝗥𝗦/𝗨𝗧𝟯/𝗧𝗼𝘂𝗹𝗼𝘂𝘀𝗲 𝗜𝗡𝗣 (𝟮 𝗺𝗼𝗶𝘀) : Au cours de ma première année, j’ai eu l’opportunité de rejoindre l’équipe "Regulation and Dynamics of Wood formation" du LRSV pour un stage de deux mois, portant sur la régulation de la formation du bois par le froid chez l'Eucalyptus. Cette expérience m’a offert une première immersion dans le monde de la recherche, en plus de m’avoir permis de développer des compétences pratiques essentielles. -𝗦𝘁𝗮𝗴𝗲 𝗮𝘃𝗲𝗰 𝗹’Ecole d'Ingénieurs de PURPAN 𝗲𝘁 𝗹'INRAE-CNRGV (𝟲 𝗺𝗼𝗶𝘀) : En deuxième année, j’ai été accueilli par l’unité PPGV pour un projet de recherche collaboratif nommé "SteviOmics" visant à comprendre la biosynthèse des composés au pouvoir sucrant de la Stevia, dans le cadre d’un stage de six mois. J’y ai principalement réalisé des travaux en bioinformatique : exploration du cluster genobioinfo, codage sous Linux, assemblage de génomes et de transcrits, prédiction de gènes, etc. Sans formation initiale en bioinformatique, ce fut un véritable challenge que j’ai cependant relevé grâce au soutien d’experts formidables. 💪 💼 𝗖𝗲 𝗾𝘂𝗲 𝗷𝗲 𝗿𝗲𝗰𝗵𝗲𝗿𝗰𝗵𝗲 : Je suis déterminé à poursuivre dans le monde de la biologie, et je cherche donc activement un poste dans un laboratoire pour continuer à enrichir mes connaissances scientifiques, contribuer à des projets innovants et mûrir professionnellement. 📍 𝗟𝗼𝗰𝗮𝗹𝗶𝘀𝗮𝘁𝗶𝗼𝗻 : Toulouse et périphérie 📅 𝗗𝗶𝘀𝗽𝗼𝗻𝗶𝗯𝗶𝗹𝗶𝘁𝗲́ : dès maintenant 🙏 𝗩𝗼𝘁𝗿𝗲 𝗮𝗶𝗱𝗲 𝗺’𝗲𝘀𝘁 𝗽𝗿𝗲́𝗰𝗶𝗲𝘂𝘀𝗲 : Si vous connaissez des opportunités ou des personnes dans ce domaine, je serais ravi d’entrer en contact avec elles. Un partage de ce post pourrait grandement m’aider à trouver le poste idéal pour évoluer dans cet univers qui me passionne. Je vous remercie par avance pour votre aide précieuse et reste à disposition pour échanger sur toute opportunité qui pourrait correspondre à mon profil. Bien à vous, Simon SKRZYPCZYK
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La date butoir approche très vite ! N'oubliez pas de soumettre votre poster avant le 19 janvier de préférence ! #poster #bioinformatique #montpellieromicsdays #MODs #montpellieromicsdays2024 #MODs2024 #montpellier #UM #universitédemontpellier #omics #biologie #informatique #science #bioinformatics #biology #informatics
Vous êtes intervenant, chercheur, doctorant ou postdoctorant et vous avez un poster à présenter ? Nous vous proposons de venir l’exposer lors des MOD ! Vous pourrez parler de votre poster au public lors de créneaux spécifiquement réservés. Pour cela, il suffit de vous inscrire via notre site internet en cochant l’option de présentation de poster. Il vous faudra renseigner sa thématique (qui doit être liée au thème principal des MOD), et éventuellement une description. Si votre poster est retenu, vous devrez ensuite l’envoyer avec son titre et un résumé d’environ une à deux pages avant la date limite, le 19 janvier à 20h00. #poster #bioinformatique #montpellieromicsdays #MOD #montpellieromicsdays2024 #MOD2024 #montpellier #UM #universitédemontpellier #omics #biologie #informatique #science #bioinformatics #biology #informatics
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Ingénieur sur la Plateforme GENOM'IC de l'Institut Cochin ➡️ gestion des projets de séquençage (transcriptomique, epigénétique) ➡️ analyse des données (ChIPseq, ATACseq, CUT&Tag)
📣📣📣 Il reste une semaine pour déposer votre demande d'inscription pour l’École de Bioinformatique IFB - Inserm 2024 (EBAII24) “Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit”. Cette formation est structurée autour d'une combinaison de sessions théoriques et d'ateliers pratiques. Les participants auront l'occasion d'explorer diverses thématiques, notamment le traitement de données de Variants, ChIP-Seq, Bulk RNA-Seq, et Single-Cell RNA-Seq. De plus, ils recevront une introduction aux technologies "long reads". Objectifs généraux: Acquérir une compréhension approfondie des concepts liés à l'analyse de données NGS. Maîtriser les outils informatiques nécessaires pour effectuer ces analyses. Interpréter les résultats des analyses de données NGS. La formation se déroulera du 17 au 22 novembre 2024, à Roscoff. La date limite des inscriptions est fixée au 14 juin 2024.
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#urgent #Emergency #stage #M1 #Bioinformatique Bonjour à tous, Je suis actuellement étudiant en Master de Bio-informatique, avec un intérêt marqué pour la bio-analyse et l'analyse des séquences. Au cours de mon dernier stage, j'ai travaillé sur l'évaluation et l'optimisation des paramètres de ColabFold pour améliorer la précision des prédictions de structures protéiques. Mes principales réalisations incluent : - L'évaluation systématique et l'optimisation des paramètres de ColabFold pour obtenir des prédictions de haute qualité. - La prédiction de complexes protéiques en utilisant ColabFold. - La visualisation des régions de contact protéiques avec ChimeraX. - L'analyse des régions conservées entre les séquences. - La comparaison de mes prédictions avec celles disponibles sur la base des données UniProt et la prédiction via Foldseek pour validation et affinement des résultats. Cette expérience m'a permis de développer une expertise en modélisation moléculaire, en analyse des séquences et en validation comparative des structures protéiques. En outre, je possède des compétences python , R , analyse des données en RNAseq et en transcriptomique, ce qui élargit mon champ de compétences en bioinformatique et me permet d'aborder des problématiques variées, allant de l'analyse des données transcriptomiques à la modélisation des interactions moléculaires. Mon véritable intérêt réside dans la bioanalyse, où je souhaite continuer à enrichir mes compétences pratiques et théoriques. Je suis particulièrement intéressé par des projets impliquant la bioanalyse, la modélisation moléculaire, l'analyse des séquences, ou toute autre recherche en bio-informatique structurelle. Je suis disponible immédiatement et ouvert à toute opportunité et serais heureux de discuter de toute proposition ou recommandation. Merci d'avance pour votre aide et vos suggestions. Bien cordialement, IDRISS MAHAMAT
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Venez découvrir la microfluidique pour la biologie !!
🚀 Formation CNRS - Biologie dans les systèmes microfluidiques 🔬 Vous êtes ingénieurs biologistes souhaitant utiliser ou utilisant la microfluidique ? Préparez-vous à : ✔ 1 : Connaître les techniques liées à l’utilisation de puces microfluidiques appliquées à des problématiques biologiques diverses (dynamiques et structurelles à différentes échelles : cellulaire et pluricellulaire) ✔ 2 : Savoir concevoir et créer un modèle pertinent qui permette de retranscrire les fonctions biologiques ✔ 3 : Savoir microstructurer en relief un support pour mimer la topologie biologique d’intérêt ✔ 4 : Savoir mettre en place un montage expérimental permettant d’observer et d’étudier les relations entre structures et fonctions cellulaires Et enfin, cliquez sur le lien en commentaire pour vous inscrire à cette formation. #microfluidics #science #scienceandtechnology #plateformetechnologique #IPGG #biologie #formation #cnrs
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BTC5734-2024-UNIVERSIDADE DE SAO PAULO INTRODUCTION AU SUJET : C'est un sujet que j'enseigne depuis 23 ans, ce qui est un grand privilège et une immense responsabilité : celle d'avoir, au fil du temps, recherché et vérifié avec diligence l'évolution des connaissances conformément à ce qu'indiquaient les premières preuves observées vers 2001. La biologie est désormais proposée comme une thermodynamique évolutive dissipative, et la génétique peut être comprise comme une physique de l'information. La génétique se révèle donc être un système complexe d'opérateurs logiques, et il existe également des preuves extraordinaires que les algorithmes sententiels sont capables de comprendre et de structurer la grammaire/sémantique de l'évolution génomique. Les expériences récentes de dialogue avec les LLM offrent des aperçus très importants sur l'évolution des sous-graphes recombinants, indicateurs des paramètres phénoménologiques des interfaces possibles entre l'intelligence artificielle et la biologie artificielle. Lorsque le cours BTC5734 a débuté en 2001, l'idée était d'explorer les concepts et les applications de la théorie de l'information, de la théorie des systèmes et de la bioinformatique naissante à la biologie et à la biotechnologie.
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