Здравствуйте! Извините за задержку с ответом.

1). Активация. Вас никто не заставляет купить. Это стандартное окно версии с сайта, когда программа не активирована. Там три варианта действий: активировать (ввести свой ключ от версии с сайта), купить или попробовать Демо, запустив программу без активации. Так вот у Стим версии такое может случиться если программа деактивировалась. Это может произойти при смене железа (HWID) или сетевого адреса например. Нужно просто активировать повторно запустив из библиотеки, а не с корневой папки например если так делаете или ярлыка.
2). Сцена очень крайне редко ломается при обновлении, так, чтобы ее не было видно и в целом, это может произойти если аварийно завершить работу компьютера например, но от этого есть защита и это специально не повторяется, как и сказал редкая история.
Если сцена не видится в интерфейсе программы, значит скорее всего она битая, при открытии файла сцены будут нули в текстовом редакторе, тут уже ничего не поделаешь. Удаляйте, создавайте с нуля и делайте резервную копию файла сцены на случай той же переустановки системы или программы начисто.

Все ваши сцены хранятся в папке с настройками в ProgramData, открыть можно из меню Помощь. Папка Scenes. Там и стандартные, которые можно менять. В папке установки программы также есть папка scenes, но там они только для чтения, на случай резервного восстановления из меню Сцены - Менеджер сцен. Включите внизу галочку Показать заготовки сцен, выберите нужную и нажмите Новая из заготовки.

Сейчас, скиньте в поддержку файл вашей сцены из ProgramData, посмотрим можно ли восстановить, и выполните чистую установку с удалением всех настроек из ProgramData.