New study reshapes our understanding of P-bodies as active participants in RNA regulation, not just storage! We collaborated with the laboratoire de Biologie du Développement from Sorbonne Université by constructing the libraries and performing Illumina sequencing from human cell lines 🔬 https://lnkd.in/e6RNzMCY
GenomiqueENS
Services de recherche
Paris, Île-de-France 278 abonnés
Expert en génomique fonctionnelle eucaryote
À propos
La plateforme génomique de l’Institut de Biologie de l’École normale supérieure (IBENS) vous accompagne dans vos projets scientifiques en génomique fonctionnelle à haut débit. Nous bénéficions de plus de 20 ans d’expertise dans le domaine des analyses du transcriptome et notre certification ISO 9001 nous apporte traçabilité et rigueur dans le traitement de vos échantillons. Nous sommes membres fondateurs du réseau « Genomic Paris Centre » en partenariat avec l’Institut Curie et Sorbonne Université (ex Université Pierre et Marie Curie). Nous avons obtenu le label national Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie (IBiSA) et sommes partenaire du consortium France Génomique. Nous pouvons vous aider dans tous les aspects de vos projets en génomique que ce soit pour la préparation des demandes de financement, le conseil lors du dessin expérimental, la prise en charge de vos échantillons, l’utilisation de nos appareils, l’analyse de vos résultats ou la mise en place d’actions de formation. N’hésitez pas à parcourir ce site pour découvrir toutes nos activités et à prendre contact avec nous si vous avez besoin d’informations.
- Site web
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https://genomique.biologie.ens.fr/
Lien externe pour GenomiqueENS
- Secteur
- Services de recherche
- Taille de l’entreprise
- 2-10 employés
- Siège social
- Paris, Île-de-France
- Type
- Établissement éducatif
- Fondée en
- 1999
Lieux
-
Principal
Obtenir l’itinéraire
46, Rue d'ulm
75005 Paris, Île-de-France, FR
Employés chez GenomiqueENS
Nouvelles
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Excited to announce that our QC tool for Oxford Nanopore Technologies sequencers #ToulligQC is now available as an EPI2ME-compatible workflow! 🎉🎉 The EPI2ME Desktop application is easy to use and allows users of any skill level to run their bioinformatic analyses! Go check it out on our github https://lnkd.in/eQPQbmST and EPI2ME Labs https://lnkd.in/e26Bq44A
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How do tardigrades survive ionizing radiation? With our collaborators from AVIV at the MNHN, we uncovered DNA repair mechanisms in tardigrades by combining Illumina and Oxford Nanopore Technologies sequencing on 3 species of tardigrade. https://lnkd.in/eru_maPc
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New transcriptomic study demonstrates Decitabine as potential antiviral compound against equine rhinopneumonitis! With our collaborators BioTargen, we performed #illumina sequencing and RNA-seq analysis from horse samples. https://lnkd.in/eNXbY2hF
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Pleased to announce our QC tool for Nanopore sequencers #ToulligQC is available as a nf-core module 🎉 Implemented in Nextflow, users can modulate ToulligQC to their need! ToulligQC 2.7 => is fast (few minutes on a laptop) => supports all versions of Guppy and Dorado => can be used with all the @nanopore sequencing devices #MinION #GridION #PrometION => accepts POD5, Fast5, FASTQ, BAM etc.. The report contains exhaustive information about the sequencing run, basecalling and demultiplexing steps => read count and length distributions, homogeneity of the run, location of potential flow cell spatial biases, statistics about pass and fail reads, data by barcodes ... Oxford Nanopore Technologies
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Notre plate-forme a le label IBISA, découvrez le GIS IBiSA 👇
Des infos et des chiffres sur les objectifs et missions du GIS IBiSA ➡️ https://lnkd.in/dB7r_85r
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GenomiqueENS a republié ceci
Ingénieur sur la Plateforme GENOM'IC de l'Institut Cochin ➡️ gestion des projets de séquençage (transcriptomique, epigénétique) ➡️ analyse des données (ChIPseq, ATACseq, CUT&Tag)
👏 Merci à Corinne Blugeon et Salomé Brunon pour leur présentation des résultats de leurs tests RNA-seq low-input sur le robot Magelia d'INOREVIA 👏 GenomiqueENS France Génomique #AGFG2024
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#bioinfo #formation Entre snakemake et nextflow, votre coeur balance ou vous avez un avis bien tranché ? Dans tous les cas, vous aimeriez mieux maîtriser un langage de workflow ? Cette formation est faite pour vous 👇 Notre plateforme et la plateforme IFB PF-IBENS sont investis pour cette formation : Laurent Jourdren est co-organisateur et Salomé Brunon participe dans l'équipe pédagogique. Plus d'infos et inscriptions ci-dessous 👇
🚀 Formation en workflows bioinformatiques ! Organisée par l’IFB et iPOP-UP, cette formation à Paris du 14 au 16 octobre est un rendez-vous à ne pas manquer pour les bioinformaticien·ne·s. Tarifs : Académique (250 €) / Non-académique (1000 €) Date limite d'inscription : 30 juin 2024 🔗 Infos : https://lnkd.in/ebvRb5F7 🔗 Inscription : https://lnkd.in/eaW7jj2U Ne manquez pas cette opportunité ! #Bioinformatique #Formation #IFB
WF4bioinfo 2024 : Les langages de workflows pour une analyse bioinformatique reproductible
moodle.france-bioinformatique.fr