[THÈSE] 🎓 Le sujet de stage que nous vous avons présenté est lié à la thèse réalisée par la chef d'escadron Audrey Gouello, chef de notre département Analyses Génétiques. ➡️ Évaluation de l'identification du microbiome des fluides biologiques pertinents pour le domaine judiciaire : Une étude pilote Évaluation de l'identification du microbiome des fluides biologiques pertinents pour le domaine judiciaire : Une étude pilote 🔎 Résumé Dans les sciences judiciaires, les fluides corporels, ou traces biologiques, sont une source d'information majeure et leur identification peut jouer un rôle déterminant dans les enquêtes criminelles. Actuellement, la nature des fluides biologiques est évaluée à l'aide de méthodes immunologiques, physico-chimiques, ARNm et épigénétiques, mais elles ont des limites en termes de sensibilité et de spécificité. L'émergence de technologies de séquençage de nouvelle génération offre de nouvelles opportunités pour identifier la nature des fluides corporels en déterminant les communautés bactériennes. L'objectif de cette étude pilote était d'évaluer si l'analyse des communautés bactériennes dans les fluides biologiques isolés et en mélange pouvait refléter la situation observée en laboratoire. Plusieurs échantillons couramment rencontrés dans les sciences forensiques ont été testés à partir de prélèvements sur des volontaires en bonne santé : salive, liquide vaginal, sang, sperme et échantillons de peau. Ces échantillons ont été analysés seuls ou en combinaison dans un rapport de 1 :1. Le séquençage a été effectué sur le séquençeur automatisé Ion Gene StudioTM S5. Les fluides testés seuls ont révélé une signature bactérienne typique avec des ordres bactériens spécifiques, ce qui a permis l'identification formelle du fluide d'intérêt, malgré les variations interindividuelles. Cependant, dans les mélanges de fluides biologiques, la prédominance de certains microbiomes bactériens a inhibé l'interprétation. Les microbiomes oraux et vaginaux étaient clairement prédominants et l'abondance relative de leurs communautés bactériennes et/ou la présence d'espèces communes entre les échantillons rendaient impossible la détection des ordres ou genres bactériens d'autres fluides, bien qu'ils se distinguent les uns des autres. Cependant, en utilisant la bêta diversité, des fluides salivaires ont été identifiés et peuvent être distingués des fluides en combinaison. Bien que cette méthode d'identification des fluides soit prometteuse, des analyses supplémentaires sont nécessaires pour consolider le protocole et assurer sa fiabilité. A retrouver dans son intégralité 👉 https://lnkd.in/dk-f6nTa #IRCGN #gendarmerie #gendarmeriescientifique #forensicscience #expert #expertise #forensique #criminalistique #Microbiome #ADN #thèse
Post de IRCGN - Institut de Recherche Criminelle de la Gendarmerie Nationale
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Des scientifiques ont fait un pas de géant en ingénierie génétique en découvrant un mécanisme appelé "puente recombinasa". Cette technique permet de "programmer" l'ADN comme un traitement de texte, offrant la possibilité de recombiner et de réorganiser l'ADN à volonté. Elle pourrait révolutionner les manipulations génétiques, similaire à la technologie CRISPR, en facilitant des modifications précises et ciblées du génome. Ces avancées ouvrent des perspectives prometteuses dans les domaines médical et biotechnologique, tout en soulevant des questions éthiques et réglementaires importantes [[❞]](https://lnkd.in/eZF8ScdG) [[❞]](https://lnkd.in/eZF8ScdG) [[❞]](https://lnkd.in/eZF8ScdG).
🔎 Génie génétique - Définition et Explications
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📌CASTp, ou Computed Atlas of Surface Topography of Proteins, est un outil largement utilisé dans le domaine de la bioinformatique et de la biologie structurale. Il est principalement utilisé pour identifier et analyser les cavités et les poches de liaison sur les surfaces des protéines. Voici quelques-unes des principales utilisations de CASTp : 🔹Identification des sites actifs :CASTp peut aider à identifier les sites actifs des protéines, c'est-à-dire les régions où les molécules se lient à la protéine pour déclencher une réaction biologique. 🔹Conception de médicaments :En comprenant la topographie des surfaces protéiques et des poches de liaison, CASTp peut être utilisé pour concevoir de nouveaux médicaments ou améliorer l'affinité des médicaments existants envers leur cible. 🔹Compréhension des interactions protéine-protéine :CASTp permet d'analyser les interactions entre différentes protéines en identifiant les régions de contact et les sites potentiels d'interaction. 🔹Étude de la structure et de la fonction des protéines :En fournissant des informations sur la topographie des surfaces protéiques, CASTp aide les chercheurs à mieux comprendre la structure et la fonction des protéines dans les systèmes biologiques. 🔹Analyse de la stabilité des protéines :CASTp peut être utilisé pour prédire l'impact des mutations ou des modifications de la structure protéique sur la stabilité et la fonction de la protéine. 🔸En résumé, CASTp est un outil précieux pour les chercheurs en bioinformatique et en biologie structurale, offrant des informations précieuses sur la topographie des surfaces protéiques et des poches de liaison, ainsi que sur leur rôle dans divers processus biologiques. #bioinformatique #biologie_structurale #biology
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🌟 Travail sur l'extraction d'acides nucléiques avec le MagCore Automated Nucleic Acid Extractor HF16Plus 🌟 🧬 Acides nucléiques : Macromolécules organiques constituées de nucléotides, essentielles pour le code génétique. Deux principales catégories : ADN : Contient l'information génétique (génomique, plasmidique, mitochondrial). ARN : Crucial pour l'expression génique et la synthèse des protéines (ARNm, ARNr, ARNt, ARNnc, ARN viral). 🔬 Étapes d'extraction avec le MagCore HF16Plus : 🧪 Préparation des échantillons. 🧼 Lyse des cellules. 🧲 Liaison aux billes magnétiques. ⚙️ Isolation magnétique. 🚿 Lavage des billes magnétiques. 🔄 Élution des acides nucléiques. 🧊 Stockage ou analyse. 🌟 Importance du MagCore HF16Plus : Outil clé pour des extractions d'acides nucléiques rapides, efficaces et de haute pureté, utilisé en recherche biomédicale, criminalistique et biologie moléculaire. #BiologieMoléculaire #RechercheBiomédicale #MagCore
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Analyse différentielle de données ARN-seq à la paire de bases DiffSegR : une méthode d'analyse de l'expression différentielle pour des données d’ARN-seq utilisant la détection de ruptures Pour comprendre pleinement la régulation des gènes, il est nécessaire d'avoir une compréhension approfondie à la fois du transcriptome et des activités enzymatiques et de liaison à l'ARN qui le façonnent. Bien que l’avènement de l’ARN-Seq soit allé de pair avec le développement de nombreux outils dédiés à l’analyse du transcriptome, la plupart de ces outils ne considèrent que l'abondance des lectures de séquençage le long de motifs annotés (tels que les gènes). Malheureusement, ces annotations sont très souvent incomplètes, ce qui conduit à des erreurs dans les analyses d'expression différentielle. Pour répondre à ce problème, les équipes OGE et GNET de l'IPS2, avec le soutien du Phenoscope, de la plateforme POPS et du LaMME, ont publié dans NAR Genomics and Bioinformatics DiffSegR, un package R qui permet de découvrir les différences d'expression à l'échelle du transcriptome entier entre deux conditions biologiques en utilisant des données d'ARN-Seq. DiffSegR ne nécessite pas d'annotation préalable et utilise un algorithme de détection de ruptures pour identifier les limites des régions exprimées de manière différentielle en analysant le log2 du rapport entre les niveaux d'expression des deux conditions étudiées par paire de base. En quelques minutes de calcul, DiffSegR a pu prédire avec justesse les rôles des ribonucléases chloroplastiques Mini-III et PNPase dans la maturation de l'ARNr et la dégradation en 3' et en 5' des précurseurs d'ARNm, d'ARNt et des introns excisés. Nous pensons que DiffSegR sera bénéfique pour les biologistes utilisant la transcriptomique car il permet d'accéder à des informations provenant d'une couche du transcriptome négligée par les « pipelines » d'analyse de l'expression différentielle classiquement utilisés aujourd'hui. DiffSegR est disponible à l’adresse ici : https://lnkd.in/eXCNa6As.
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La conception précise des protéines offre de l’espoir pour les cœurs et les reins endommagés. En utilisant des protéines conçues par ordinateur, les chercheurs ont maintenant montré qu’ils sont capables de diriger des cellules souches humaines pour qu’elles forment de nouveaux vaisseaux sanguins en laboratoire. Cette étape importante dans la médecine régénérative offre un nouvel espoir pour réparer les cœurs, les reins et d’autres organes endommagés. Lire: https://lnkd.in/ebmFtRuk Hannele Ruohola-Baker University of Washington - School of Medicine #sciencesdelavie #biotechnology #biotechnology #innovation #innovations #research #sciences #medicaments #research #drugresearch #laboratories #labs #chemistry #chemistry #biology #biologie #biopharma #rna #rnatherapeutics #arn #revolution #happy
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Une avancée majeure dans la thérapie par ARN pour les maladies du cœur et du système nerveux. Des chercheurs de l'Université de Californie à San Diego ont mis au point de nouvelles techniques pour sculpter des molécules d'ARN en cercles qui pourraient donner lieu à des traitements plus puissants et plus durables. Cette avancée est prometteuse pour plusieurs maladies et offre un substitut plus durable aux thérapies à base d'ARN actuelles, qui ont souvent une demi-vie courte dans l'organisme. Lire: https://lnkd.in/e275SJKN #sciencesdelavie #biotechnologie #biotechnology #innovation #innovations #research #sciences #medicaments #research #drugresearch #laboratories #labs #chemistry #chemistry #biology #biologie #biopharma #rna #rnatherapeutics #arn #lifesciences #revolution #happy
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La conception précise des protéines offre de l’espoir pour les cœurs et les reins endommagés. En utilisant des protéines conçues par ordinateur, les chercheurs ont maintenant montré qu’ils sont capables de diriger des cellules souches humaines pour qu’elles forment de nouveaux vaisseaux sanguins en laboratoire. Cette étape importante dans la médecine régénérative offre un nouvel espoir pour réparer les cœurs, les reins et d’autres organes endommagés. Lire: https://lnkd.in/eAK3YXFd Hannele Ruohola-Baker University of Washington - School of Medicine #sciencesdelavie #biotechnology #biotechnology #innovation #innovations #research #sciences #medicaments #research #drugresearch #laboratories #labs #chemistry #chemistry #biology #biologie #biopharma #rna #rnatherapeutics #arn #revolution #happy
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Une avancée majeure dans la thérapie par ARN pour les maladies du cœur et du système nerveux. Des chercheurs de l'Université de Californie à San Diego ont mis au point de nouvelles techniques pour sculpter des molécules d'ARN en cercles qui pourraient donner lieu à des traitements plus puissants et plus durables. Cette avancée est prometteuse pour plusieurs maladies et offre un substitut plus durable aux thérapies à base d'ARN actuelles, qui ont souvent une demi-vie courte dans l'organisme. Lire: https://lnkd.in/edgvmCfC #sciencesdelavie #biotechnologie #biotechnology #innovation #innovations #research #sciences #medicaments #research #drugresearch #laboratories #labs #chemistry #chemistry #biology #biologie #biopharma #rna #rnatherapeutics #arn #lifesciences #revolution #happy
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Des structures d’ARN inhabituelles pourraient être des cibles pour de nouveaux traitements contre la SLA Une équipe dirigée par le Dr Marco Di Antonio de l'Imperial College London, en collaboration avec le Dr Lorenzo Di Michele (University of Cambridge) et le professeur Rickie Patani (The Francis Crick Institute et Institut de neurologie UCL Queen Square), a étudié un mécanisme alternatif qui pourraient conduire à la formation d'agrégats dans la SLA et ont découvert que des formes inhabituelles d'ARN pouvaient jouer un rôle clé dans leur accumulation. Lire: https://lnkd.in/eR6Xb8Am #sciencesdelavie #biotechnologie #biotechnology #innovation #innovations #recherche #sciences #medicaments #research #drugresearch #laboratories #labs #chemistry #chimie #biology #biologie #biopharma #rna #rnatherapeutics #arn #wewillwin
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