IPS2

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À propos

À l’IPS2, nous voulons mieux comprendre les mécanismes génétiques et moléculaires qui contrôlent la croissance de la plante et leurs régulations par les signaux endogènes et exogènes d’origine biotique (symbiotiques et pathogènes) et abiotique, notamment en relation avec le changement climatique. L’analyse de ces mécanismes est effectuée de manière intégrée à l’échelle de la cellule, de l’organe jusqu’à la plante entière. L’IPS2 applique une approche multidisciplinaire en combinant la génomique/epigénomique, la biologie cellulaire, la bio-informatique, la biochimie, la génétique, et la physiologie, développe des outils de modélisation indispensables pour une biologie prédictive, et facilite la recherche translationnelle des espèces modèles aux espèces cultivées. L'unité dispose de deux plates-formes regroupant différentes installations dédiées aux plantes : -EPITRANS : Biologie Translationnelle (grandes collections de TILLING en tomate, melon, concombre...) et Epigénomique (analyses génomiques telles que ChIPseq, HiC et autres) -SPOMICS : Transcriptomique, Interactomique (interactions protéines-protéines) et Métabolomique. L’IPS2 est la résultante d’une importante restructuration et unification en 2015 de 3 des 4 instituts impliqués dans le Laboratoire d’Excellence / Ecole Universitaire de Recherche Sciences des Plantes de Saclay (SPS). La création de l’IPS2 a permis de mieux structurer les activités de recherche, de formation et d’innovation en accord avec les objectifs de SPS. Nous favorisons aussi l'implication des équipes d’IPS2 dans des projets innovants avec des partenaires industriels et/ou des instituts techniques, et nous accueillons différentes start-ups, afin qu'IPS2 contribue à l’agriculture de demain

Site web
https://ips2.u-psud.fr/fr/index.html
Secteur
Services de recherche
Taille de l’entreprise
51-200 employés
Siège social
Gif/Yvette, Gif/Yvette
Type
Administration publique
Fondée en
2015

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Employés chez IPS2

Nouvelles

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    La parthénocarpie, un mécanisme de nouaison indépendant de la pollinisation pour garantir la stabilité des rendements Dans une étude récente, publiée dans la revue Trends in Plant Science, des scientifiques de l’équipe FloCad à IPS2 ont réalisé une revue exhaustive des mécanismes moléculaires qui régulent la nouaison. Le développement des fruits est un processus crucial pour la reproduction des plantes à fleurs et constitue une source alimentaire majeure à l'échelle mondiale. Cependant, le changement climatique représente une menace considérable pour les rendements fruitiers, car il perturbe les processus de pollinisation et de fertilisation. Ces processus sont particulièrement sensibles aux températures extrêmes, à l'insuffisance de lumière, et au déclin des populations de pollinisateurs. Cet article de revue met en lumière les mécanismes moléculaires sous-jacents à la parthénocarpie, qui correspond au développement de fruits sans fécondation, en soulignant les rôles des facteurs de transcription, des ARN non-codants, et de phytohormones clés telles que l'auxine, les gibbérellines, et les cytokinines. L'étude explore en profondeur ces résultats, propose des modèles régulateurs, et identifie des domaines où des recherches supplémentaires sont nécessaires. Cette compréhension approfondie de la parthénocarpie pourrait ouvrir la voie à des stratégies innovantes pour protéger et améliorer la production fruitière face aux défis environnementaux croissants

    • La pollinisation et le développement des fruits en danger à cause du réchauffement climatique
Schéma décrivant les effets des changements climatiques sur la pollinisation et le développement des fruits
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    L’effecteur de type III NopL interagit avec GmREM1a et GmNFR5 pour promouvoir la symbiose chez le soja.   La mise en place des interactions symbiotiques entre les légumineuses et les rhizobia nécessite une signalisation symbiotique complexe activée par les facteurs Nod (NFs) de rhizobium et/ou par des effecteurs de type III (T3E). Cependant, les mécanismes par lesquels différents signaux régulent conjointement l’interaction symbiotique ne sont pas encore entièrement connus. Dans une étude publiée dans le Journal Nature communication les laboratoires du Pr. Dawei Xin (Northeast Agricultural University, Harbin, Chine), et de P. Ratet (équipe SYMUNITY, IPS2) ont décrit un mécanisme de communication croisée entre l’effecteur T3SS NopL de Sinorhizobium fredii et la signalisation des Facteurs Nod (NFs) bactériens chez le soja (Glycine max). NopL interagit physiquement avec la rémorine 1a du soja (GmREM1a) et le récepteur des NFs NFR5 (GmNFR5), et favorise le recrutement de GmNFR5 par GmREM1a. En outre, NopL et les NFs influencent l'expression de GmRINRK1, un récepteur kinase orthologue de RINRK1 chez Lotus japonicus, qui agit comme médiateur de la signalisation des NFs. Ces travaux indiquent que NopL interagit avec des composants de la cascade de signalisation symbiotique des NFs pour promouvoir l'interaction symbiotique chez le soja. https://lnkd.in/ed5W7Jbu

    • Modèle montrant le rôle de l'effecteur bactérien T3SS NopL sur la signalisation des facteurs Nod lors de l'interaction soja-rhizobium. NopL augmente l'interaction GmREM1-NFR5 pour favoriser la signalisation symbiotique.
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    Dr Adriana S. Hemerly donnera un séminaire le mardi 15 octobre 2024 à 11h00 dans la salle rouge du bâtiment enseignement.  « Plants for the Future : modulating the crosstalk between cell cycle and plant metabolism » Invitation : Martin CRESPI

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    Dr Maria Eugenia Zanetti donnera un séminaire le vendredi 13 septembre 2024 à 11h00 dans l'Amphithéâtre du bâtiment enseignement. "An LBD transcription factor acts downstream of ARF2 to control nodulation and root architecture" Invitation : Martin CRESPI

    • Dr Maria Eugenia Zanetti
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    Dr Andrew Nelson donnera un séminaire le vendredi 06 septembre 2024 à 14h00 dans l'Amphithéâtre du bâtiment enseignement. "Combining systems biology and molecular approaches to identify plant stress regulators" Invitation : Martin CRESPI

    • Dr. Andrew Nelson
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    Les rongeurs choisissent les graines selon leur odeur   Le choix des semences par les rongeurs sauvages est pertinent pour une agriculture durable   Dans une étude publiée dans le journal Scientific Reports, le laboratoire du Pr. Dawei Xin (Northeast Agricultural University, Harbin, Chine), en collaboration avec le Dr. P. Ratet (équipe SYMUNITY, IPS2), a montré que les graines de soja cachées sous terre pendant l'hiver par Tscherskia triton et Apodemus agrarius possèdent une concentration plus élevée de Composés Organiques Volatils (VOCs) que celles qui restent en surface des champs. Cela suggère que les rongeurs sélectionnent les graines produisant des VOCs tels que le 3-FurAldehyde (Fur) et le (E)-2-Heptenal (eHep). Ces VOCs inhibent la croissance de pathogènes végétaux comme Aspergillus flavus, Alternaria alternata, Fusarium solani et Pseudomonas syringae. En outre, des composés tels que le camphène (Cam), le 3-FurAldehyde et le (E)-2-Heptenal inhibent la germination des graines de soja, riz, maïs et blé. De plus, certains de ces VOCs empêchent également la germination des graines de riz avant la récolte. Par conséquent, nos résultats proposent des approches simples pour améliorer la protection des semences, réduire la germination avant récolte, ainsi que la perte de nourriture après la récolte. Ces résultats suggèrent aussi de nouvelles voies de sélection agronomique pour réduire l'utilisation de pesticides en agriculture. https://lnkd.in/erfNfiuU

    • Inhibition de la croissance de champignons pathogènes par des Composés Organiques Volatils (VOCs) présents dans les graines de soja. (a) Test Halo montrant l’activité antifongique de six composés organiques volatils. (b) Pourcentage d'inhibition du développement d’Aspergillus flavus, Alternaria alternata et Fusarium solani par ces six VOCs. Les barres portant des lettres différentes sont significativement différentes. Phtalate de diméthyle (DP) ; Camphène (Cam); 3-FurAldéhyde (fur); (E)-2-Hepténal (eHep); Butyrate d'isobutyle (BuA); 1-Acétylimidazole (Ace).
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    Dr Ajay SUBBAROYAN donnera un séminaire jeudi 18 juillet 2024 à 11h00 dans la salle rouge du bâtiment Enseignement : « Leveraging developmental landscapes for model selection in Boolean gene regulatory networks »  Venez nombreux ! Invitation : Olivier MARTIN

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    La voie systémique « Compact Root Architecture 2 » permet l’accumulation des cytokinines et du miR399 dans des plantes de Medicago truncatula satisfaites en N Les plantes utilisent une combinaison de voies locales et systémiques sophistiquées pour optimiser leur croissance en fonction de la disponibilité hétérogène des nutriments dans le sol. Les légumineuses peuvent acquérir de l’azote minéral (N) soit par leurs racines, soit via une interaction symbiotique avec des bactéries rhizobia fixatrices d’azote hébergées dans des nodosités racinaires. Dans un article récemment publié dans le « Journal of Experimental Botany », en collaboration avec Marc Lepetit (Montpellier) and Wouter Kohlen (Wageningen, The Netherlands), l'équipe de Florian Frugier s'est intéressée à identifier les signaux systémiques agissant des parties aériennes vers les racines chez les plantes de Medicago truncatula en réponse à un déficit ou à une satiété en N. Dans ce but, les plantes ont été cultivées dans un système expérimental de « split-root », dans lequel une quantité élevée ou faible de N est fournie à la moitié du système racinaire, permettant ainsi l'analyse des voies systémiques indépendamment de la réponse locale en N. Parmi les familles d’hormones végétales analysées, la cytokinine trans-Zéatine s’accumule dans les plantes en satiété N. L'application localisée de cytokinine via un pétiole conduit à une inhibition à la fois de la croissance des racines et de la nodulation. De plus, une analyse exhaustive des miARNs a révélé que miR2111 s'accumule de manière systémique sous déficit en N à la fois dans les parties aériennes et dans les racines distantes non-traitées, alors qu'un miARN lié à l'acquisition de phosphate inorganique (Pi), le miR399, s’accumule dans les plantes cultivées en satiété en N. Ces deux profils d'accumulation dépendent de CRA2 (« Compact Root Architecture 2 »), un récepteur requis pour la signalisation des peptides CEP (« C-terminally Encoded Peptide »). L'expression ectopique constitutive du miR399 réduit le nombre de nodosités et la biomasse des racines en fonction de la disponibilité du Pi, ce qui suggère que le module de régulation de l'acquisition du Pi dépendant du miR399, contrôlé par la disponibilité en N, affecte le développement de l'ensemble du système racinaire des légumineuses. https://lnkd.in/eDR7Buk7

    • Le miR399 s'accumule dans les plantes à satiété en azote, contrairement au miR2111.

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